1963 metų gruodžio 14 d. Kaišiadorių rajono darbo žmonių deputatų tarybos komiteto pirmininko Mykolo Gudžiaus ir Danutės Lekečinskienės sprendimu buvo leista mieste įsteigti vaikų muzikos mokyklą. Šis dokumentas adresuotas tuometinei Švietimo ministerijai, prašant, kad nuo 1964 m. rugsėjo 1 d. Kaišiadoryse būtų atidaryta vaikų muzikos mokykla su chorinio dainavimo, akordeono ir pučiamųjų instrumentų klasėmis.
Muzikos mokyklos įkūrimą inicijavo liaudies švietimo skyriaus vedėjas R. Kapcevičius. Laikinai muzikos mokyklai buvo paskirtos patalpos miesto 1 – oje vidurinėje mokykloje (dabar Algirdo Brazausko gimnazija), vėliau – Vytauto gatvėje esančiame pastate.
Kaišiadorių muzikos mokykla įkurta 1964 m. rugsėjo 1 d. apie tai byloja tuometinio Kaišiadorių rajono DŽD tarybos vykdomojo komiteto pirmininko Mykolo Gudžiaus ir tarybos sekretorės Danutės Lekečinskienės 1963 m. gruodžio 14 d. pasirašytas sprendimas.
Šis dokumentas adresuotas tuometinei Švietimo ministerijai, prašant, kad nuo 1964 rugsėjo 1 d. Kaišiadoryse būtų atidaryta vaikų muzikos mokykla su choro dirigavimo, akordeono ir pučiamųjų instrument klasėmis. Muzikos mokyklos įkūrimą inicijavo tuometinis rajono Liaudies švietimo skyriaus vedėjas R. Kapcevičius. Laikinai muzikos mokyklai buvo paskirtos patalpos miesto I–oje vidurinėje (dabar kaišiadorių Algirdo Brazausko gimnazija) mokykloje, vėliau Vytauto gatvėje esančiame pastate.
1995 m. rugpjūčio 23 d. mokykla buvo naujai įregistruota jau nepriklausomos Lietuvos Respublikos švietimo įstaigų registre.
Pradžioje mokykloje veikė tik muzikinis skyrius. Vėliau atsirado poreikis sudaryti sąlygas didesniam mokinių skaičiui ugdytis muzikos mokykloje dailės, šokio, teatro srityse. 2001 m. atlikus rajono gyventojų apklausą ir įvertinus situaciją, Kaišiadorių rajono savivaldybei buvo pateiktas muzikos mokyklos plėtros projektas. Šis projektas Kaišiadorių rajono savivaldybės tarybos 2002 m. kovo 28 d. sprendimu Nr 480 buvo įtrauktas į Kaišiadorių rajono 2002 – 2006 m. plėtros programą. Pagrindinis projekto įgyvendinimo tikslas – siekti, kad Kaišiadorių muzikos mokykla taptų meno mokykla, tenkinančia viso rajono vaikų ir jaunimo meninio ugdymo poreikius. 2006 m. Kaišiadorių rajono tarybos 2006 m. kovo 30 d. sprendimu Nr. V 17 – 1272 patvirtinti nuostatai ir suteiktas meno mokyklos statusas.
Sudarius sutartis trumpalaikiams užsiėmimams su bendrojo ugdymo mokyklomis, chorinio dainavimo programos veikia:
Žiežmarių, Kruonio gimnazijose, Žaslių pagrindinėje mokykloje.
Kaišiadorių rajono savivaldybės tarybos 2012 m. birželio 28 d. sprendimu Nr. V17 – 233 buvo patvirtinti Kaišiadorių meno mokyklos nuostatai ir įsteigtas Kaišiadorių meno mokyklos Rumšiškių filialas.
Pirmuoju vaikų muzikos mokyklos direktoriumi buvo paskirtas:

(1964–1965 m.)
Vėliau dirbo direktoriai:

(1965–1979 m.) ir (1989–1999 m.)

(1979–1982 m.)

(1982–1986 m.)

(1986–1989 m.)

(1999–2005 m.)

(2005–2014 m.)
(2015–2024 m.)
Kaišiadorių muzikos (dabar meno) mokykloje per 5 dešimtmečius įvyko daug pokyčių. Kintant visuomenės poreikiams kūrėsi naujos programos – styginių, liaudies instrumentų. 2001–2003 m. atsirado naujos meninio ugdymo programos – choreografijos, dailės, ankstyvojo meninio ugdymo, kryptingojo meninio ugdymo, meno mėgėjų programa, prasiplėtė chorinio dainavimo programa. Sudarius sutartis trumpalaikiams užsiėmimams su bendrojo ugdymo mokyklomis chorinio dainavimo klasės veikia Žiežmarų, Kruonio gimnazijose, Žaslių pagrindinėje mokykloje. 2006 m. Kaišiadorių rajono tarybos sprendimu mokyklai suteiktas meno mokyklos statusas, 2012 m. įsteigtas Kaišiadorių meno mokyklos Rumšiškių filialas. Kito mokykloje besimokančių skaičius. Įkūrus mokyklą mokėsi 80 mokinių. Vėliau vidutinis mokinių skaičius mokykloje buvo 350 mokinių. Tapus meno mokykla 2006–2007 m. mokėsi 587 mokiniai; 2009–2010 m. – 665 mokiniai. Dabartiniu metu mokosi 520 mokinių.
Mokykloje aktyvią koncertinę veiklą vysto jaunučių, jaunių chorai, akordeonų, liaudies instrumentų orkestrai, įvairios sudėties kameriniai ansambliai. Meno kolektyvai ir atlikėjai aktyvūs respublikinių švenčių dalyviai, tarptautinių ir respublikinių konkursų laureatai, Gran prix laimėtojai.
Malonu, kad baigę aukštąjį muzikinį, dailės mokslą į mokyklą grįžta dirbti buvę jos mokiniai. Tai Elena Radlinskaitė – Jakubauskienė, Gintarė Vainaitė, Regina Stankauskaitė – Griesiuvienė, Robertas Ramunis, Arvydas Kairevičius, Regina Sabakonytė – Girčienė, Regina Rikterytė, Renaldas Grigaliūnas, Daiva Uždravytė – Pilkienė, Vilmantas Kratavičius, Juozas Kupčiūnas, Sigita Nistelytė – Adžgauskienė, Laima Mažuolytė, Asta Kapačiūnaitė – Tamašauskienė, Kristina Marcevičiūtė – Tokarevienė, Stanislovas Straševičius, Rita Šustavičiūtė – Marcinkevičienė.
Vėliavą sukūrė ir išsiuvinėjo tautinio paveldo kūrėja Diana Tomkuvienė.
Pavasaris – ir pro mokyklos langus
Melodijos lyg paukščiai skris ir skris…
O muzika, brangioji mano mūza,
Dėkoju, kad atvėrei man šias duris.
Eilutėmis sutūpę juodos natos,
Fortepijono blizgantis viršus,
Tau ačiū, mokykla, kitaip, kad matom,
Už stebuklingus muzikos garsus.
Priedainis:
Senas smuikas atsiduso
Vėjas vėl stygas užgaus.
Ką davei mums – viskas mūsų –
Daug išsinešam brangaus.
Gražiausias metų laikas iškeliauti
Obels žiedais paženklintu taku,
Bet nors trumpam čionai nekart sugrįšim,
Kai bus gyvent be muzikos sunku.
Pried.
Pavasaris – ir pro mokyklos langą
Lydėdami mus mokytojai pamojuos
Ir muzika, brangioji mano mūza,
Lyg paukštė virš galvos sparnais plasnos.
Pried.